Основними напрямками наукової роботи кафедри екології та агрономії є:
- проведення наукових досліджень;
- підготовка і захист кандидатських дисертацій, керівництво аспірантами;
- випуск монографій, навчальних підручників та посібників, публікація наукових праць (статей, доповідей);
- організація та проведення наукових конференцій та нарад, участь співробітників кафедри у всеукраїнських та міжнародних науково-практичних конференціях, семінарах;
- робота над госпдоговірними, держбюджетними та позабюджетними науково-дослідними темами;
- участь співробітників кафедри у роботі ради громадських екологічних інспекторів обласного управління Мінекології, консультування та постійна співпраця з державними органами управління в галузі екології та агрономії, органами місцевого самоврядування, та іншими державними установами та організаціями;
- керівництво науково-дослідною студентською роботою;
- міжвузівське наукове співробітництво.
Наукові напрямки кафедри:
- збереження та підвищення родючості грунтів в межах якої проводиться НДР за темою: “Розробка технологій виготовлення органічних добрив методом біоферментації в умовах ССЗ Західного Полісся України“ 0120U105769
- охорона довкілля, можливості розширення ПЗФ в межах якої проводиться НДР за темою: “Наукове обґрунтування оптимізації структури та функціонування і оптимізація екологічної мережі та об’єктів природно заповідного фонду Волинської області“ 0120U105768.
Співробітники кафедри приймали участь у конференціях, які проводяться в ЛНТУ та інших навчальних закладах, наукових установах.
Спільно з облдержадміністрацією приймали участь у розробці Програми охорони навколишнього середовища м. Луцька на 2010-2012 роки.
Налагоджено співпрацю з Луцькою міською радою за темою: ”Оптимізація системи збору та утилізації твердих побутових відходів у м. Луцьку та приміській зоні”; з Володимир-Волинською міською радою – за темою: ”Зниження техногенного впливу полігону твердих побутових відходів на транскордонні території”.
Здійснюється наукова співпраця і консультування фахівцями кафедри державних, громадських та недержавних науково-дослідних установ, виробничих організацій та підприємств м. Луцька та Волинської області:
1) відділу раціонального природокористування і охорони природних ресурсів Луцької міської ради за напрямками:
- робота над екологічним паспортом міста,
- оптимізація організації екологічної освіти та виховання в шкільних закладах освіти м.Луцька.
2) підприємства “Луцькводоканал” за напрямками:
- основні шляхи та заходи екологічної оптимізації водокористування та водовідведення міста,
- оптимізація якості питної води: сучасні методики.
3) Поліська дослідна станція національного наукового центру "Інститут ґрунтознавства і агрохімії імені О.Н. Соколовського", за напрямками:
- дослідження екологічного стану ґрунтів Волині,
- проблеми оптимізації стану радіоактивно забруднених земель північних районів області,
- розробка карти агроекологічного районування ґрунтів Волині.
4) Волинська філія державної установи «Інститут охорони родючості ґрунтів України». за напрямками:
- екологічний моніторинг земель Волині,
- складання кадастру еродованих та порушених земель і ґрунтів Волинської області.
5) Шацького національного природного парку за напрямками:
- вивчення екологічного стану озера Світязь,
- розробка схеми екологічного моніторингу оз. Світязь та прилеглої території,
- дослідження мікрокліматичних особливостей території Шацького національного природного парку, що формуються під впливом озера.
6) Волинського регіонального гідрометеоцентру за напрямками:
- здійснення екологічного моніторингу стану атмосферного повітря у м. Луцьку,
- розробка карти екологічного районування стану атмосферного повітря в межах урбоекосистеми Луцька,
- забезпечення стаціонарного моніторингу стану атмосферного повітря в зонах транспортного і промислового напруження.
На базі всіх перерахованих організацій згідно укладених договорів проводиться виробнича практика студентів-екологів та збір і обробка вихідних матеріалів до виконання наукових студентських досліджень, дипломного проектування.
У Волинській області ефективно працює громадська екологічна організація „Чисте довкілля Волині”, директором якої є доцент кафедри екології та агрономії, к. с.-г. н. Мерленко І.М.